企業(yè)在生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)的物料采購(gòu)中，一般會(huì)涉及農(nóng)產(chǎn)品的采購(gòu)。而企業(yè)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅的計(jì)算，主要根據(jù)企業(yè)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)的納稅人身份和適用的不同的稅率，以及取得農(nóng)產(chǎn)品不同的采購(gòu)發(fā)票等，也就是說(shuō)，企業(yè)從一般納稅人和小規(guī)模納稅人購(gòu)進(jìn)和取得農(nóng)產(chǎn)品發(fā)票等，其增值稅進(jìn)項(xiàng)稅的計(jì)算結(jié)果是不同。
應(yīng)該說(shuō)，稅法明確規(guī)定了企業(yè)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品的如何抵扣進(jìn)項(xiàng)稅。其購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅的計(jì)算方法，具體包括如下幾個(gè)方面：
一是企業(yè)購(gòu)進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品，取得的是一般納稅人開(kāi)具的增值稅專用發(fā)票或海關(guān)進(jìn)口專用繳款書的，那么以增值稅專用發(fā)票或海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書上注明的增值稅稅額為進(jìn)項(xiàng)稅額，在計(jì)算增值稅時(shí)可以抵扣。
二是企業(yè)購(gòu)進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品，是從簡(jiǎn)易計(jì)稅法依照3%征收率計(jì)算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人，取得的增值稅專用發(fā)票的，在計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅時(shí)，不是按照3%的征收率計(jì)算扣除率，而是按照增值稅專用發(fā)票上注明的采購(gòu)金額和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。
三是企業(yè)購(gòu)進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品，取得或自行開(kāi)具農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票或收購(gòu)發(fā)票的，以農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票或收購(gòu)發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價(jià)和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額?，F(xiàn)實(shí)時(shí)，自行開(kāi)具農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票的企業(yè)也很多，比如生豬屠宰企業(yè)，收購(gòu)的毛豬，均是企業(yè)自行開(kāi)具的農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票。稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)自行開(kāi)具的農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票的管理也很嚴(yán)格。
四是企業(yè)購(gòu)進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品，用于生產(chǎn)銷售或委托加工執(zhí)行增值稅13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品，按照10%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。企業(yè)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅額的計(jì)算公式：進(jìn)項(xiàng)稅額=買價(jià)*適用的扣除率。
五是企業(yè)購(gòu)進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品，用于企業(yè)混合銷售行為的，即用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物又用于生產(chǎn)銷售其他貨物服務(wù)的，作為企業(yè)應(yīng)當(dāng)分別核算用于生產(chǎn)銷售或委托受托13%稅率貨物和其他貨物服務(wù)的農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅額。
而如果企業(yè)沒(méi)有分別核算的，則需要統(tǒng)一以增值稅專用發(fā)票或海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進(jìn)項(xiàng)稅額，或以農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票或銷售發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價(jià)和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。
六是對(duì)煙葉稅企業(yè)按規(guī)定繳納的煙葉稅，準(zhǔn)予并入煙葉產(chǎn)品的買價(jià)計(jì)算增值稅的進(jìn)行稅額，并在計(jì)算繳納增值稅時(shí)予以抵扣。購(gòu)進(jìn)煙葉準(zhǔn)予抵扣的增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額，按照收購(gòu)煙葉實(shí)際支付的價(jià)款總額和煙葉稅及法定扣除率計(jì)算。計(jì)算公式為，煙葉稅應(yīng)納稅額=收購(gòu)煙葉實(shí)際支付的價(jià)款總額*稅率（20%），準(zhǔn)予抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額=（收購(gòu)煙葉實(shí)際支付的價(jià)款總額+煙葉稅應(yīng)納稅額）*扣除率。
另外，企業(yè)從批發(fā)、零售環(huán)節(jié)購(gòu)進(jìn)適用免征增值稅政策的蔬菜、部分鮮活肉蛋而取得的普通發(fā)票，不得作為計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的憑證。
在此需要說(shuō)明的是，自2017年7月1日起，以購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值稅一般納稅人，可以納入農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定扣除試點(diǎn)范圍，其購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品無(wú)論是否用于列入試點(diǎn)生產(chǎn)的產(chǎn)品，增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額均按照《農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定辦法》的規(guī)定抵扣。其核定方法主要包括投入產(chǎn)出法、成本法和參照法。
總之，企業(yè)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)項(xiàng)稅的計(jì)算，需要根據(jù)購(gòu)進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)取得發(fā)票的性質(zhì)，農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)增值稅納稅人身份，以及企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)業(yè)務(wù)的內(nèi)容等確定適合的扣除率，進(jìn)而確定企業(yè)收購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品的進(jìn)項(xiàng)稅額，即進(jìn)項(xiàng)稅額等于買價(jià)乘以扣除率。另外，符合農(nóng)產(chǎn)品增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額核定征收的一般納稅人，按照稅法的規(guī)定計(jì)算增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額。