根據(jù)《財(cái)政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于規(guī)范個(gè)人投資者個(gè)人所得稅征收管理的通知》(財(cái)稅[2003]158號(hào))規(guī)定：納稅年度內(nèi)個(gè)人投資者從其投資企業(yè)(個(gè)人獨(dú)資企業(yè)、合伙企業(yè)除外)借款，在該納稅年度終了后既不歸還，又未用于企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營的，其未歸還的借款可視為企業(yè)對(duì)個(gè)人投資者的紅利分配，依照“利息、股息、紅利所得”項(xiàng)目計(jì)征個(gè)人所得稅。根據(jù)上述規(guī)定，如果個(gè)人股東從公司借款是用于企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營的，比如借款去出差的、借款去農(nóng)村收購農(nóng)副產(chǎn)品的等，是不需要繳納個(gè)人所得稅的;同時(shí)，個(gè)人股東從公司借款，只要該納稅年度終了前(即當(dāng)年12月31日)歸還了借款的，也是不需要繳納個(gè)人所得稅。
在實(shí)務(wù)中，因?yàn)閭€(gè)人股東分紅會(huì)涉及20%的個(gè)人所得稅，有些企業(yè)實(shí)現(xiàn)的利潤長期不分紅，而采取股東借款形式而達(dá)到間接分紅不繳個(gè)稅目的，為了堵漏這個(gè)漏洞，對(duì)個(gè)人股東借款長期不還視同分紅。所以，對(duì)個(gè)人股東從公司借款需要繳納個(gè)人所得稅，主要是防止某些人利用借款的形式，達(dá)到非法逃避繳納個(gè)人所得稅的目的。
那么，股東借款后期歸還了是不是可以申請(qǐng)退稅呢?目前，總局沒有退還個(gè)人所得稅的相關(guān)政策。但在有的地方明確是可以退稅的。如《河北省地方稅務(wù)局關(guān)于秦皇島市局個(gè)人投資者借款征收個(gè)人所得稅問題請(qǐng)示的批復(fù)》(冀地稅函[2013]68號(hào))規(guī)定：個(gè)人投資者歸還從其投資企業(yè)取得的一年以上借款，已經(jīng)按照“利息、股息、紅利”征收的個(gè)人所得稅，應(yīng)予以退還或在以后應(yīng)納個(gè)人所得稅款中抵扣。