?Sanger
Sanger發(fā)音
英:[?s??ɡ?] 美:[?s???]
英: 美:
Sanger中文意思翻譯
Sanger測(cè)序的原理?
Sanger測(cè)序是一種DNA測(cè)序方法,由Frederick Sanger等人發(fā)明。其原理是通過(guò)在DNA合成過(guò)程中逐漸加入一種二進(jìn)制的特殊核苷酸,使其在合成過(guò)程中隨機(jī)地被加入,并以此得到DNA序列信息。
下面是詳細(xì)的Sanger測(cè)序原理及步驟:
1. 實(shí)驗(yàn)人員首先需要將待測(cè)DNA復(fù)制許多份,即制備大量的DNA模板。
2. 對(duì)DNA模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以增大樣本中目標(biāo)序列數(shù)量。
3. 在PCR反應(yīng)中,使用特殊的、與普通核苷酸不同的dNTPs,稱為ddNTPs。ddNTPs在DNA合成中一旦被加入,便會(huì)終止合成,從而導(dǎo)致合成長(zhǎng)度的隨機(jī)截?cái)唷?/p>
4. 截?cái)喑龅腄NA片段分別按照大小進(jìn)行電泳分離。
5. 逐個(gè)讀取DNA分子,根據(jù)大小排序。使用帶標(biāo)簽的引物,利用熒光或放射性標(biāo)記物來(lái)掃描單個(gè)ddNTP引起的 DNA鏈的末端長(zhǎng)度。熒光會(huì)因dNTPs生物化學(xué)反應(yīng)而失活。
6. 以這種方式進(jìn)行的一次測(cè)序,只能獲得目標(biāo)DNA區(qū)域的一端,需要反復(fù)進(jìn)行多次測(cè)序。
7. 最后,通過(guò)多次測(cè)序結(jié)果疊加得到目標(biāo)DNA序列。
Sanger 雙脫氧法測(cè)序原理,簡(jiǎn)述測(cè)序技術(shù)發(fā)展趨勢(shì)
DNA鏈中的核苷酸是以3`,5`-**酸二酯鍵相連接,合成DNA所用的底物是2`-脫氧核苷三**酸(dNTP),在Sanger 雙脫氧鏈終止法中被摻入了2`,3`-雙脫氧核苷三**酸(ddNTP),當(dāng)ddNTP位于鏈延伸末端時(shí), 由于它沒(méi)有3`- OH,不能再與其它的脫氧核苷酸形成3′,5′-**酸二酯鍵,DNA合成便在此處終止,如果此處摻入的是一個(gè)ddATP,則新生鏈的末端就是A,依次類推可以通過(guò)摻入ddTTP、 ddCTP、 ddGTP ,則新生鏈的末端為T、C或G,根據(jù)這個(gè)原理,Sanger與1977年建立了雙脫氧鏈終止測(cè)序法。他本人也因此而獲得了諾貝爾獎(jiǎng)。
以單鏈或雙鏈DNA為模板,采用DNA引物引導(dǎo)新生DNA的合成,因此又稱為引物合成法,或酶促引物合成法。主要是基于DNA聚合酶的催化特性:①以DNA為模板,根據(jù)堿基配對(duì)的原則逐個(gè)將dNTP加到與模板結(jié)合的寡核苷酸引物的3′-OH末端,形成正確的模板DNA互補(bǔ)鏈;②能以dNTP作為底物,也能利用ddNTP作底物,將其摻入寡核苷酸鏈的3 ′末端而終止新生互補(bǔ)鏈的延伸。
如果在DNA的合成反應(yīng)中,除了加入4種正常的脫氧核苷三**酸(dNTP)外,再加入一種少量的2ˊ,3ˊ ddNTP,那么多核苷酸鏈的延伸將與偶然發(fā)生但卻十分特異的鏈終止展開(kāi)競(jìng)爭(zhēng),所以反應(yīng)產(chǎn)物是一系列的長(zhǎng)短不一的核苷酸鏈。
在4組獨(dú)立的DNA合成反應(yīng)中,分別加入4種不同的ddNTP,結(jié)果將生成4組核苷酸鏈,它們將分別(隨機(jī))終止于每一個(gè)A,每一個(gè)G,每一個(gè)C,每一個(gè)T的位置上。對(duì)這4組核苷酸鏈進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳,就可讀出序列。
測(cè)序現(xiàn)在是第二代技術(shù)為主,454,solexa,solid等等,以后將基于納米技術(shù),進(jìn)行單分子測(cè)序
比如隧道探針?lè)ǖ?/p>